Al finalizar la temporada 2008/09 , Saúl quedo libre y decidió fichar por el club rival , el Atlético de Madrid en el cual jugaría en la categoría juvenil hasta el año 2010 que debido a su gran capacidad futbolística subió al segundo equipo , el Atlético de Madrid B llegando a tener un valor de 2 millones de euros .

En la temporada 2012/13 alternaba entrenamientos con el primer y segundo equipo hasta lograr debutar el 8 de marzo de 2012 en un partido europeo y poder cumplir su sueño mas preciado , se ganó la confianza del astro argentino y fue sumando minutos aunque menos de los que él creía que debía jugar ;  se acordó su cesión al Rayo Vallecano y así conseguir confianza y experiencia y así fue .

Un año más tarde volvió al equipo que le vio crecer y lucho para ganarse un puesto en el 11 a pesar de la gran competencia en su posición y con trabajo lo logró.